眼科于建院早期隶属于五官科， 1978年从五官科分离并迅速发展。独立设科后，专业收治各种眼科疾病患者，科室业务不断拓展，水平不断提高，吸引了闵行周边地区及市区甚至外省市的一些眼疾患者纷纷慕名而来。床位逐渐增加到1990年时为13个，1998年时增加到21个。科室2000年起被闵行区卫生局评为“闵行区特色专科”。成为上海西南地区唯一开展项目较全面、综合实力较强的眼科，开展的部分项目达三级医院水平。
从90年代开始，科室逐渐添置了各种先进的诊疗仪器，如眼科A/B超诊断仪，玻璃体切割机，超声乳化机，非接触式眼压仪，自动视野仪，电脑验光仪，眼科氩激光仪及YAG激光仪、眼底摄像分析仪等。并逐步开展玻璃体切除、白内障晶体超声乳化等手术，使第五人民医院在当时成为全市最早有能力进行此类手术的医院之一。近年来我科在眼后节手术及前后节联合手术方面不断拓展，逐步形成眼前后节常见病及疑难重症治疗特色，包括白内障超声乳化摘除+玻璃体切除+眼内光凝+人工晶体植入联合手术治疗糖尿病性视网膜病变；联合手术并应用硅油、重水治疗复杂视网膜剥离；玻璃体切除+注气/+剥膜治疗黄斑裂孔等，其中一些技术难度较高，在本市内亦属先进。在小儿眼病，弱视治疗等方面亦有显著疗效。2003年科室又添置了综合验光仪，开展医学验光，使科室验光水平及相关眼病的诊疗水平提高了一个层次。
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我科在科研方面进行了多项研究，累计发表论文 14篇，科研立项5项， 其中部分获奖。通过长期的医疗实践及外出培训，眼科人才梯队、技术力量不断发展壮大，主治医师各有专长。近年又新进两名研究生，为科室增添新的力量及活力。
承担复旦大学公共卫生学院和皖南医学院医疗系等实习生教学任务。
科室现状：
眼科病房现有床位 21张，年收治病人约400人次，手术400余人次。年门急诊量约25000人次。现有医护人员共10人，其中副主任医师1人，主治医师6人，住院医师2人，护士1人。原眼科许速主任现任闵行区卫生局局长，聘为眼科顾问，帮助和指导工作。 复旦大学眼耳鼻喉科医院教授不定期帮助指导工作。
拥有 A/B超眼科诊断仪，双人双目无级变倍手术显微镜、间接检眼镜、多台裂隙灯显微镜、玻璃体切割机，超声乳化机，非接触式眼压仪，自动视野仪，电脑验光仪，眼科氩激光仪及YAG激光仪、眼底摄像分析仪、综合验光仪等先进的诊疗仪器。
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